История Печерского района Киева неделимо связана с возникновением и развитием столицы Украины. Занимая территорию исторических местностей и урочищ на правом берегу Днепра, современный Печерский район вобрал в себя Владимирскую горку, Перевесище-Крещатик, Липки, Киево-Печерск, Венгерское, Аскольдову могилу, Берестовое, Наводничую, Зверинец, Выдубичи, Верхнюю Теличку, Саперную Слободку, горы Лысую, Черную, Багриновую, долины Клова и частично Лыбеди.

Над Днепром, вблизи урочища Венгерское, в 882 г. Олег убил киевских князей Аскольда и Дира и стал властвовать в Киеве, сказав: «Это будет мать городов русских». Князь Владимир Святославович в 988 г. ввел в Украине-Руси христианство, соорудил первые храмы. На месте крещения киевлян возвышается памятник-колонна. А впоследствии, в 1051 г. монахи Антоний и Феодосия основали в выкопанных вблизи княжеского села Берестового пещерах православный монастырь — будущую Киево-Печерскую Успенскую Лавру. Отсюда и пошло название района. Кроме лаврских, известны еще не менее древние Зверинецкие пещеры и прочие пещеры на землях района.

Первые мурованые сооружения в районе появились еще в XI в. в Печерском монастыре. Слава его распространилась на весь православный мир, потом Киев стал огромным притягательным центром и возникла поговорка «Язык до Киева доведет» — на богомолье, на Печерск, где при монастыре уже в XII в. существовало значительное поселение.

В конце XVII века Печерский городок становится военно-административным центром Киева. Гетман Иван Самойлович начинает сооружение земляной крепости, а впоследствии гетман Иван Мазепа возводит оборонительные стены с башнями, церквями вокруг лавры, дает большие средства на церковное строительство. Полковники Войска Запорожского также предоставляют средства на развитие и украшения Печерского, Никольско, Выдубицкого, Михайловского Златоверхого монастырей, на развитие украинской национальной культуры; ее распространяли и лаврская школа, лаврские типография и иконописная мастерская.

Разноплановое значение Печерска растет на протяжении последующих времен. В середине XVIII века здесь возводятся Царский (Мариинский) и Кловский дворцы, дом киевских генерал-губернаторов, мурованые ворота и пороховые погреба, совершенствуются фортификационные сооружения Печерской крепости. В конце XVIII века напротив лавры строится огромный арсенал из желтого киевского кирпича. Зеленую глину для обжига этого кирпича добывали здесь же, на склонах Днепра и Лыбеди, и те кирпични стали первыми промышленными предприятиями района. Из такого же кирпича построена впоследствии вся новая Печерская крепость на огромном плато — Васильковское и госпитальное укрепления, казармы, оборонные башни, стены, новый арсенал, а еще — институт благородных девушек, быки Цепного моста через Днепр.

С развитием капитализма быстро растет и строится Киев. В XIX веке возникает улица Крещатик, и старый Киев сливается с Печерском. Образуются характерные участки застройки и расселения киевлян. Деловой Крещатик — банки, конторы, биржа. Аристократические Липки — роскошные особняки царской администрации и богатых киевлян. Надднепрянськие сады. Полувоенный, полуцерковный Печерск, с единственным промышленным предприятием — заводом «Арсенал». Мещанський Зверинец, Саперная Слободка, монастыри, кладбища и просто рощи, урoчища на горах и в оврагах. Место казней — Лысогорский форт. На изломе XIX—XX веков на землях современного Печерского района уже действовали городской Музей древностей и искусств, залы Дворянского и Купеческого собраний, ипподром.

Во время первой мировой войны Печерск быстро милитаризируется: расширяется арсенал, сводятся военные училища, прокладываются железнодорожные пути ко всем военным объектам. Освободительные соревнования 1917—1920 годов делают Печерский район ареной братоубийственных боевых действий, а карательные органы каждой противоборствующей стороны выбирают своей резиденцией помещичьи Липки.

Новый подъем переживает Печерский район после 1934 года, когда с переводом столицы Украины из Харькова в Киев в Липках разместились правительственные учреждения. Одновременно было уничтожено множество памятников культовой архитектуры, кладбище на Аскольдовой могиле. В 1930-е годы построено здание Верховной Рады, гигантский дом НКВД (ныне — здание Кабинета Министров), клубы, школы, детские сады и ясли, многочисленные жилые дома, стадион «Динамо», набережную Днепра.

Вторая мировая война нанесла страшные раны как всему городу, так и Печерску. Лишь в 2000-е годы восстановлен из руин Успенский собор лавры, уничтоженный во время оккупации города фашистскими войсками.

В послевоенные годы одними из первых массово были застроены коттеджами окраины — Багринова гора, Старонаводницкая улица, потом началось массовое строительство многоэтажных жилых домов в южной части района — улицы Бастионная, Киквидзе, бульвар Дружбы народов. В 1960-е годы проложено и застроено бульвар Леси Украинки и прилегающие улицы. В старинном Аносовском саду в 1957 году устроен парк Славы с обелиском и Вечный огнем над Могилой неизвестного солдата и с 34 могилами героев, павших в боях за Киев в 1941 и 1943 годах. Парк Славы по устоявшейся традиции стал местом общегородского торжества в День Победы.

В последние десятилетия в районе появилось много новых общественных сооружений и заведений, а также жилые массивы.

Сейчас в Печерском районе, занимающем площадь 27 кв. км, проживает 126,2 тысячи киевлян, тут действует около 30 промышленных предприятий, 28 научно-исследовательских и проектных институтов, четыре высших учебных заведения, восемь техникумов и профтехучилищ, 15 средних, одна вечерняя, две спортивные школы и 17 дошкольных учреждений, четыре больницы и военный госпиталь, пять поликлиник, учреждения торговли и общественного питания и другие заведения.

Впервые район как административную единицу создано в 1921 году, в 1924 году — район переименован в Ленинский, а в 1936 — на Кировский, с 1941 года — Печерский.